庄生梦蝶

2010，不同寻常

zhuangg — Sat, 01 Jan 2011 03:01:12 +0000

又到辞旧迎新，时间过得太快。聊记数笔不寻常的2010年，也许以后会想念它。

今年起了几样大变化。先是书读到了尽头，虽然博士学位不值钱，但毕竟拿到手了，满足全家老小的学位情节吧。再是离开学校，进入公司，下文谈感受。最重要的，老婆送给我们的巨大惊喜－－肚子里的宝宝，让这一年名副其实的不同寻常。

十二月一日，老婆和我结婚三年纪念日，那几天我有很大的感触，因为这一年我们分隔两地，真是特别艰难。尤其是老婆，怀孕半年来独自一个人，没有受过一天照顾。现在我们迫不及待地盼望着团聚，一起迎接父母到来，等候宝宝出生，享受天伦之乐。生活虽然辛苦，我们仍然非常感恩，它给予我们不尽的希望，以及发自心底的快乐。

这一年，在老婆的鼓励下，我也成功地终于和社会接轨，由象牙学府跨入公司的门槛，尽管工作性质没有根本改变，然而感受，视野，思想，都在新的环境中日新月异。八个月的时间，似乎仅仅过了八周，可以说每天都很兴奋，包括初期适应时那小小的阵痛。以前总在赶着完成项目，发表文章，打造美好前程，如今扎下心来，更多得考虑去做重要的踏实的研究，用自己的手来推动领域的发展，希望有一天能够促进癌症的治疗。更难能可贵的，公司提供了最好的资源帮助我们实现这样的愿望，我感到在快到而立之年的时候，突然得到了自己最喜欢的工作，就像发现新大陆一般高兴。明年希望老婆顺利毕业，来这里和我一起工作。

新一年的愿望：老婆和宝宝健康平安；我俩的父母身体健康，能来美国探亲；老婆取得学位，找到理想工作；我研究中的一些发现，可以确认并有进一步突破。

最后祝愿每一位朋友新年快乐，期待也分享你们不同寻常的2010。

纳什维尔—旧金山

zhuangg — Fri, 16 Apr 2010 21:34:06 +0000

很长时间没有更新了，生活变化很大，现在我在旧金山，下周一将是我在Genentech开始工作的日子。

三月初通过了答辩，之后一直在赶完最后一个项目，终于临行前把文章投出去。期间还因为申请OPT的失误，致使上班时间延后两周，好在忙于各种杂务，并没有感到空乏。

四月四日，复活节，离开呆了近六年的纳什维尔，和老婆开车向加州出发。一路经过田纳西州，阿肯萨斯州，俄克拉荷马州，德克萨斯州，新墨西哥州，亚利桑那州，内华达州，加利福尼亚州，沿途风光不断变化，虽然开车时间很久，也没有觉得劳累。四月的天气不算太热，走到西部荒漠时不至于担心车子经受不住。我们在Oklahoma City和Albuquerque各停了一夜，在Las Vegas停了两晚，中间休息一天，结果吃了两顿包肥（buffet），每次撑破肚皮。结论是拉斯维加斯不可久留，容易伤身体。一路下来，发现美国同我们伟大的祖国一样，地大物博，在New Mexico, Arizona以及Nevada渺无人烟的地方，一整天看不到城镇的痕迹，只有连绵起伏的砂石山，和散落在旷野里的印第安人家。

到达旧金山后，老婆陪我呆了一个星期，找到了住处，办理了银行账户和手机，基本上稳定下来了。现在老婆回去纳什维尔继续学业，我开始在新环境里适应一个人的生活，感到自己照顾自己，有点力不从心了。

期待新工作的开始。

就这样从了？

zhuangg — Fri, 23 Oct 2009 18:44:40 +0000

上回说到找工作得到第一个面试，没想到竟然要成为最后一个，真是很崩溃。

十月八号收到Ferrara秘书邮件，将面试选在了十月二十日。公司帮我定机票和酒店，我用十天把相关的文献粗粗看了一遍，每日头晕眼花。最后几天把要讲的内容做成了幻灯片，考虑到讲话容易快，凑了五十多张，以免听众觉得无聊。出发前的周末和朋友一起重游大雾山，在山里转了两天，并且很幸运地赶上一场大雪，山顶上真是银装素裹，美不胜收。周日晚上回到家，老婆烦了愁，不晓得面试让我穿什么衣服。出去借了领带，试穿了十余种不同组合，最后还是决定西装西裤衬衫皮鞋，搞笑的是西装上衣和西裤不是一身。

周一清早的飞机，在达拉斯中转，因为旧金山大雨，延误了两小时，到达时已是傍晚。在公司工作的师兄接机，把我送到宾馆，晚上我粗略得准备了一下明天的讲座，没多会儿就累得昏睡过去。

周二是一整天的面试，早上酒店送我到公司去，实验室所在的楼就在旧金山海湾的旁边，窗外就是大海，真是名副其实的湾区。先和老板谈，接着实验室里的博后和员工，在实验室讲座，中午实验室的人带我到餐厅吃饭。下午继续轮番面谈，最后是两个比较新的老板和公司人力资源部门的代表。总之讲了一天话，脑袋都大了。大部分时候是比较随意的聊天，问实验室的情形，公司里的资源，还有公司的运作与学校的不同，以及前景和出路；只是最后有一个中国人老板和我谈得很深入，认为我还没有做好准备，把我讲得出了一身冷汗。我感觉最重要的部分还是讲自己做过的工作，一是要比较充实，二是要有点实用性，三是要有一些真知灼见。

公司的资源和待遇的确要比学校好太多，这个实验室从来没有为钱烦恼过，什么都可以买，公司有各种各样的服务，并且是专门为实验室设置的，比学校要专业很多。博后的工资和福利更是让人羡慕，年薪五万多，给五千块搬家费，每年三周假期，如果不休就折换成工资发给你，医疗保险眼保牙保公司全包，免费停车，最有趣的是如果不开车，每天发你四块钱。但也有很不好的地方，譬如公司很难像学校那样比较自由的交流和开放，很多资源比在学校难以得到；再就是人员较少，每人有自己的很多工作，实质的合作并不多；还有这个实验室，老板功成名就，并不十分进取，具体的指导就少了很多，博后进来后从头开始，出成果的周期比较长，大部分人四年的期限里只能完成一篇文章。

Ferrara对我挺满意的，要我回头说一下自己的想法。从加州回来后和老婆商量了很久，问了学校里的一些大小老板，觉得这是一个很好的机会。其实主要的原因也是申请的其他大牛没有一个人理我，虽然我们更倾向于去学校，也毫无办法，倘若去一些不好的实验室，倒不划算了。于是给Ferrara写信表明了意向，今天收到回信，要我向三个推荐人要推荐信，公司会开始正式的发OFFER的过程。

所以，不出意外，几个月后我就要到加州工作了。

第一个面试

zhuangg — Fri, 02 Oct 2009 21:59:29 +0000

找工作进入第二个月，今天终于得到一个面试。

晚上老婆要从希腊开会回来，下午就没有安排很多事，坐在实验室里发呆。突然电话响起来，心想找我的肯定是中国人，很大声地喊了句“喂”，没想到对方一阵叽哩呱啦，听不太懂，后来才弄明白是我申请的一个工作。我本来以为先要电话面试一下，没料到只是确定我还在找工作的过程中，就要我过去直接面试了。

这是我申请的第一个实验室，Genentech公司的Napoleone Ferrara，意大利人，讲话特别难懂，好在我以前rotation的时候在Ambra Pozzi那里受过训练。提起他的贡献来，应该是如雷贯耳，我一直觉得如果他不是在公司，肯定已经得诺贝尔奖了。八十年代，他发现了VEGF，九十年代，他做了VEGF的抗体，经过十几年的开发，2004年VEGF的抗体Avastin获得FDA通过，成为第一个抑制肿瘤血管的药物。目前Avastin是Genentech最赚钱的药物，2008年卖了27亿美金，不知道Napoleone Ferrara能分到多少^_^

面试应该是十一月份，等我回来再讲一下面试的情况，现在的任务是把他的所有重要论文再看一遍，顺便将整个angiogenesis的领域再理解一番，免得到时被大牛羞辱。

找工作还没有很积极，上个月分两批共投了八个实验室，绝大多数杳无音讯，弄得我不知道怎么办好，因为其实最想去的实验室不是很多。这个月还要再寻找一批小牛，如果还是没有进展，大概就留在纳什维尔了。

第八篇

zhuangg — Fri, 21 Aug 2009 16:48:51 +0000

A determining role of the EphA2 receptor tyrosine kinase in resistance to trastuzumab therapy. Cancer Research.

Guanglei Zhuang,
Dana M. Brantley-Sieders, David Vaught, Jian Yu,
Lu Xie,

Sam Wells, Dowdy Jackson,
Rebecca Cook, Carlos Arteaga, and Jin Chen

上次第七篇的时候预告过这篇，老板想投Nature Medicine，我的预期是Cancer Research，看来我的经验已经很可靠了，哈哈。果然这篇文章初投Nature Medicine，被拒，改投JCI，再被拒，最后落到Cancer Research。比较顺利，初审后意见并不多，一个月就补好了实验，然后就接收了。Cancer Research在癌症这个领域里不是最顶尖的杂志（2008IF 7.514），只能算是大家都还比较认同的，几乎每一个做相关研究的人，或早或晚总会在这里发上一篇，所以不好意思，和我的第一篇JBC一样，我又落入俗套了。

一个项目完全结束的时候，应该是一种如释重负的感觉。因为每一篇论文，都是漫长的周期，无数的失败，以及reviewer惨无人道的打击，堆集成的。可是这次很奇怪，并没有这种轻松感，反而更觉得压力很大。因为要考虑怎么和老板谈毕业，怎么样出去找工作，学业和家庭的协调，一系列的问题。其实半年前就开始为这些事扰心，但因为没有到最后关头，所以一直拖下来，现在没有办法，只能直面了。

所以接下来的几个月，估计会有千变万化。既感到忐忑不安，又觉得隐隐兴奋，毕竟又是人生一个时期的结束，另一个时期的开始。我会把一些进展放到这里，让家人和朋友看到。如果大家也在面临毕业和找工作，欢迎交流，特别是相似的领域，相信几个人共同的努力会比一个人的力量更有成效。

下篇预告，本来以为这是研究生期间的最后一篇，没想到还没结束。下一篇仍然是自己的项目，和之前一直在做的有所不同，是我有意的一个新的尝试，所以现在还没有底，不知道这篇文章可以投到什么杂志。目前的状态是已经完成了大部分工作，在比较集中的解决最后也是最重要的问题，希望有一些更激动人心的发现，预计毕业前后投出去。

行程

zhuangg — Fri, 17 Apr 2009 04:07:19 +0000

每年总会有一段时间，行程特别紧密，最近又开始奔波不定的生活。

先是忍耐住老板的拖沓，终于把manuscript准备到差强人意，月底投出。比预计晚了两个月，不用说，毕业自然要晚两个月。上周五开
committee
meeting，大家都挺满意，过几个月得到老板首肯，应该就可以正式启动毕业程序了。现在小小心烦的是毕业之后去处，老板满心期待，留我做博后。我虽然
不急着走，但想出去探探路，怎么和老板说呢？其实说白了，就是找到好的走人，找不到好的暂且留下。老板如果知道我这么对她，一定会崩溃掉，呵呵。

这两天去华盛顿领奖，昨天一早四点出发，开车10个小时，晚上参加完活动，回酒店休息一晚，今早八点开车赶回来。之所以这么急，是因为明天要飞去丹佛开癌
症年会。现在倒在床上，倦意开始浓郁起来，好在明天下午飞机，早上可以多休息会。但是会议还没准备好，program没有看完，明早要计划好五天会议想听
的报告和想看的poster。回来之后要向全实验室转达会议精神，这次只有我自己去，要听的内容很多。

接着还有重头戏，五月份要夫妻双双把家还了，回国一个月。一个最重要的任务就是办婚礼，两边都要请客摆酒，算算时间真有限。老婆陆陆续续买了一些礼物，开
会回来之后还要最后采购一批。在北京和日照的同学、朋友们，给我留一个或发一份最新联系方式，我这里的已经有三年历史，十之八九已经过期了。有心的早点行
动了，以便我们准备礼品、安排聚餐，找不到人、见不着面的，一概不理了。

整天东奔西跑，耽误了不少时间，没办法坐下来踏踏实实的工作。希望六月份从国内回来，能静下心来站好博士最后一班岗。很多东西都想在毕业之前掌握好，很需要一段集中的时间学习。

人性化服务

zhuangg — Fri, 27 Mar 2009 16:07:16 +0000

Vanderbilt医学中心最近成立了一个Center for Science Communication，请来Vivian Siegel作director。Vivian是什么人呢？很多年前她也是做基础研究的，发了一些很好的论文。后来她到Cell作senior editor，并做到Cell和Molecular Cell的chief editor，她也是Developmental Cell和Cancer Cell的创刊人。2003年，Vivian加入Public Library of Science，帮助创办了如今声名鹊起的PLOS系列期刊。

所以，Vivian简直就是论文出版界的大姐大。对于什么样的论文更可能被editor喜欢，如何在论文撰写上下功夫，怎样准备cover letter，等一系列在论文投稿过程中可能遇到的问题，她都有着非常丰富的经验。前不久她写了一篇很有意思的文章，The promise of peer review，感兴趣的同学可以去看。

这个新成立的Center for Science Communication有好多任务，但最重要的一项是Manuscript Studio，这是所有Vanderbilt的实验室可以免费使用的一项服务，主要目的是帮助那些有可能投入好杂志的论文。manuscript写成之后，提交给studio，他们进行初筛，选出有希望的文章，组织校内的专家们坐到一起会诊，讨论在投稿之前需要补充什么实验，文章怎么修改。之后在投稿的整个过程中，Vivian也会亲力亲为，辅助从cover letter到rebuttal letter的整个过程，凭借自己多年作editor的经验，和投稿杂志的editor交流，尽最大努力使文章可能被接收。

昨天，在等待了一个月之后，我即将投出的manuscript成为studio开张的第一个案例。具体过程暂不详表，说说我的感受。我觉得这项服务非常人性化，也非常有效果。通常我们在作项目时，关注的是实验结果与推论，即使写文章时也是如此，但在投稿时的着眼点有稍稍不同，除项目本身应该没有纰漏之外，推销更是一门学问。这一步常被忽略掉了，而这个studio的优势之一就是找一些富于经验的老板，坐下来就manuscript本身仔细讨论，除实验之外，讨论的着重点更在如何优化文章，一可以令editor和reviewer眼前一亮，二可以遮掩文章的弱处，甚至巧妙化弱点为优点。

当然在此过程中也学到了很多不同见解，譬如高大全的文章并不是好文章，一篇manuscript要有侧重点与方向感，一些看起来漂亮的数据，并不一定适合整篇文章的布局，应该舍得丢弃掉；再如manuscript和grant不同，grant讲究依据所知，推断将来，基于现有的发现，提出的实验设计和结果预测，在逻辑上应该是缜密的，而manuscript常常忌讳这一点，如果一篇新论文仅仅是前人研究逻辑上的下一步，毫无惊奇，相信没有人会喜欢。

总之我很享受这一项人性化服务，希望以后再有机会去更多得体验它。

等咱有了钱

zhuangg — Fri, 20 Feb 2009 19:38:52 +0000

当美国总统实在是太爽了。周二一大早，白白净净的黑人小伙奥巴马西装革履，驾上空军一号，直奔克罗拉多，众目睽睽之下大笔一挥，7870亿美元就这样花出去了。这件事情不是每个同学都能干的。

对于科学家们来说，奥巴马简直就是东方来的再生父母，西方来的圣诞老人。因为这7870亿美元的刺激经济方案中，有210多亿注进了科学界。业内人人欢呼，奔走相告，并且一再盘算着怎么花这笔钱。

不是咱没见过钱，克林顿时期，眼睁睁NIH的预算增加了一倍，那时候大家的腰包特别鼓，整天找地方下馆子。好景不长，布什这个战争贩子一上台，七年来NIH的预算一分没长，考虑通胀因素，等同于一共减了52亿，这对每年只有300亿的NIH不是小数目。科学家们被冷落惯了，这一次都不敢相信自己的耳朵，到处问，是真的吗，是真滴吗？然后说，嘿，这个黑人小伙子可真棒。

经济危机一开始，靠别人施舍的科研界四面受敌。制药公司自身难安，慈善家们朝不保夕，各大基金越来越难申请。每个学校的投资都在受损，哈佛大学去年半年亏掉22%，我们学校好一点，亏了16.5%，已经可喜可贺，官方说法是，在这衣不敝体的环境中临危不惧。

所以，这笔钱就像天上掉馅饼一样的撒下来。我们对着高山喊，我们有钱了，我们对着大海喊，我们有钱了。

这210亿美元，100亿分给了NIH(National Institutes of Health)，30亿分给了NSF(National Science Foundation)，16亿分给了DOE(Department of Energy)的科研部门。绝大部分款项必须在明年9月之前花光，所以可想而知，这两年将是大家“分田分地真忙”的两年。兄弟们，抄好了家伙，上吧！

只是有一点我始终想不明白，这么多钱是从哪儿来的呢？美国政府能拿得出来吗？

第七篇

zhuangg — Mon, 19 Jan 2009 21:13:47 +0000

Host-deficiency in Vav 2/3 guanine nucleotide exchange factors impairs tumor growth, survival, and angiogenesis in vivo. Molecular Cancer Research.

Dana M. Brantley-Sieders, Guanglei Zhuang, David Vaught, Tanner Freeman, Yoonha Hwang, Donna Hicks, and Jin Chen

上次预告过，仍然是灌水的文章，没有值得惊喜之处。两年半前做完第一个项目时，和老板讨论下一步的工作。那时没有经验，商量出的两个项目，一个做了半年后胎死腹中，害我最后竟然要换thesis题目，惹了不少麻烦；另一个就是这篇文章，当初接手的原因是我们刚刚发表了一篇相关的论文，老板千辛万苦讨来的老鼠在那篇论文中没能好好利用，所以想用这批老鼠再做一些实验。

项目进展到一半，我实在坚持不住了，看不到任何能发好文章的前景，于时干脆搁置起来，开始做我现在的thesis项目。为此，老板对我颇为不满，并于前年底力邀实验室的名星博后来继续之前的工作。折腾了一年多，终于把水灌出来了，不用说，杂志不怎么样，影响因子4.XX

罗嗦了这么多的原因是，做研究的，尤其是老板，常常挂在嘴边的一句话：idea is cheap。意思是想法人人都有，更重要的还是做实验出来。看起来挺有道理的，可是仔细一推敲，完全靠不住。没有好的idea，第一步踏下去，就陷入万丈深渊，实验不少做，却发不了什么好paper，更重要的是，在整个项目的过程中，自己没有进步。做研究理不清大脑，手脚再利落也成不了大事，以此为戒吧。

下篇预告，自己的项目，正在做最后一个实验，争取一个月后投出。投的是Nature Medicine，我的预期是Cancer Research，又是老板逼的，别说了，眼泪花花的。

圣诞行记-3

zhuangg — Tue, 09 Jan 2007 17:34:31 +0000

吃完中饭简单休息了一会儿，晚上到Toyota Center看姚明打球，订了三张票，本来涛涛一起去，不料老板恰恰选在今日请客，即便一万个不情愿，他也没胆子得罪老板，这般不阳刚的丑事我等都做过不少，就没缘由讥笑他了，巧在亦伟的及时出现令三张票皆有了用武之地。

依着晓风嘱托早些到场，我们五点半就出门，原定乘轻轨前往，哪知飘起了朦朦细雨，我仗着有GPS导航，恶向胆边生了一回，决计开车过去。Downtown的路狭窄且不平坦，这倒是和纳城不谋而合，我们远远看见Toyota Center的大牌标，禁不住一阵欢呼，又瞧见路边一个小招牌：停车十元，心想真乃天助我也，忙不迭冲进去把车停了，交予老黑十块钱。结果一路过去，全是停车场，全有空位，全要十元，懊悔不已。

在门口拍了几张照，进门时人手领到一条篮球短裤，又沿着体育馆转了一圈，有不少吃喝玩乐的地方，拥满了兴高采烈的球迷。找到座位后呆呆守在陡峭得令人晕眩的看台上，等了整整一小时比赛才开始。主队火箭的出场非常隆重，尤其是介绍姚明时，全场一阵欢呼，麦蒂缺阵，大家的热情都集于一身。客队快船的遭遇就有点惨了，没人欢呼不说，还有人在嘘，看来美国人看球的素质也不怎么样，一点也不注重和谐。

火箭队打了个开门红，馆子顿时爆炸了一般，全场回响着"come on rocket"的加油声，姚明似乎还没活动开，不紧不慢的，只拣到两枚罚球。比赛进行至六七分钟的时候，一伙人围住抢篮板球，乱战中数人倒地，姚明被压在最下面，生生爬不起来了。我们本不以为意，眼见几分钟过去了，观众又是鼓掌又是呐喊，还不见他起来，场外医生也跑进来了，啦啦队员上了场，这才明白过来大事不好：姚明大概要下了！果不其然，不一会儿，趁着乱劲，姚明在几个人搀扶下离了场，后面一位大哥失落地说，oh，this is not good…我心想半夜开车赶来看姚明，不料结果至此，差点一口浓血喷将出来。

接下来比赛就没有看点了，火箭队既无姚明，又无麦蒂，被快船压着打，看客们渐渐失却了热忱，临近终场时已经有人提前退场了。我们随人流出来，竟然发现外面在下大雨，冲到停车处，全身都淋透了。回想与NBA的第一次亲密接触，缺前戏，开局不利，过程乏味，更无高潮，只看到一只好玩的满场乱窜的熊熊，和几个风骚的前凸后翘的啦啦女，不禁长叹，苍天无眼，小人当道，时运不济，怀才不遇啊！